現在インデックスページでサイトのトップページを構築中です。
コンテンツ部分は上段は1カラム、中段は3カラム、下段は1カラムの配置になっています。
このカラムを例えば上段1カラム、中上段3カラム、中中2カラム、中下1カラム、下段2カラムのようにカラム数を変更する事は可能ですか？
ページレイアウト管理（デザイン設定＞レイアウトタブ）画面のフリーページ作成にてインデックスページを作成されていると認識致します。
こちらでのページ作成はご認識の通り「上段は1カラム、中段は3カラム、下段は1カラムの配置」となりますので、中段を複数行（上中下の3段）に分けることができません。
複数行に分ける方法としましては、中段（コンテンツ）のエリアにフリーパーツを配置して頂き、フリーパーツの内容をHTMLモードにしてHTML形式で記載頂く方法のみとなります。
※中段には縦1列のみのパーツを配置することをお勧め致します。
横並びにパーツを配置すると2カラムとなりますので上記の様に1つのパーツ内にHTML形式で記載頂くことをお勧め致します。
以上を参照いただき、設定をお試し下さい。