自社サイトの商品ページは複数の商品を１つのページに掲載しています（カートボタンも複数）。
ページが重くお客様に何度も読み込ませたくないのでカートタグ設定「カートへ入れる」ボタンの結果を別ウィンドウで開く設定のカートボタン貼り付け用コードを使っていますが、別のウィンドウで開いたカートの画面で【ショッピングを続ける】を押すとそのウィンドウに商品ページを読み込みページが重複して開いてしまいます。
HTML形式でも【ショッピングを続ける】ボタンでページを閉じられるように設定を追加してもらえませんか？
JavaScript形式（別ウィンドウで開く）ではonclick="window.close() になっているようですが、
JavaScript形式のボタンを１ページに４つ以上設置すると同ページにあるオーダーメイドボタンを押したときに表示されるダイアログの右上 × 閉じるボタンが効かなくなってしまいます。
【ショッピングを続ける】ボタンを押して、画面が閉じされるような設定を行う機能はございませんので、【ショッピングを続ける】ボタンをスタイルシートで非表示にし、店舗様独自のボタンを設置する方法を案内致します。
まずは、ボタンを非表示にする方法です。
フリーエリアパーツ管理（デザイン設定＞レイアウトタブ）にある[ページ選択：]を「カート」に切り替えた後、以下のスタイルを追加して下さい。
<style>
.regi_flow0 .history_back_btn {
display: none;
}
</style>
スタイルの追加方法は、以下のヘルプをご覧ください。
http://emshelp.easy-myshop.jp/c-item-detail?ic=add-style
その後、上記で作成した「フリーパーツ」内でも構いませんので、
店舗様独自のボタンをHTML形式で記載して保存すれば完了です。
・ボタンの記載例
<input type="button" value="画面を閉じてお買い物を続ける" onclick="window.close();">
また、別の方法として、【ショッピングを続ける】ボタンのリンク先を変更する設定がございます。
カート設定（店長ナビ＞開店設定）にある[「戻る」ボタンの戻り先]を「その他」にチェックを入れて、表示される入力欄にページの遷移先を入力し保存して下さい。
以上、いづれかの方法をご参考の上、ボタンの設置またはリンク先の変更をご検討下さい。