メール便対応の商品のみ、それを選択できる（たとえば、厚さ2ｃｍを超える商品が含まれる場合にはメール便選択は不可能になる）というような設定は可能でしょうか？
⇒2015年8月18日のバージョンアップにて対応完了しました。
easy myShopでは、発送方法の選択機能はございません。
（現在、機能追加検討中です）
現時点では、easy myShopの送料設定機能を応用し、
ご利用いただくことをお勧めします。
（サイズ別送料に設定し、メール便負荷の商品はサイズを2cm以上に設定するなど）
⇒2015年8月18日のバージョンアップにて対応完了しました。